日本的铁路运输是旅客运输的主要方式，特别是在主要城市之间进行大规模和高速旅行以及市区通勤运输方面。它在货运中的使用相对较少，仅占货物移动的0.84％。私有化网络非常高效，几乎不需要补贴，而且准时运行。
日本的铁路旅行可能是遍及全国的最有效方式，它拥有覆盖日本全部4个主要岛屿的超过27,000公里的火车轨道网络，除其他较小的私人和私人火车外，主要由日本铁路（JR）提供服务市政运营商。日本以子弹头列车开创了高速列车，子弹头列车以其日本名字Shinkansen闻名，它以每小时320公里的时速横越全国。由于车站通常位于市中心，火车准时到达第二点，因此乘火车旅行要比乘飞机快得多。难怪2016年有超过246亿人乘坐火车旅行，这表明铁路旅行对日本人至关重要。
理解
日本的铁路是快速，高效的，并且覆盖了全国大部分地区，这使其成为大多数游客的首选交通方式。您将遇到的日本铁路系统（尤其是在东京这样的大城市内）的第一个也是最令人困惑的方面是几个专用铁路网络与JR网络的重叠。给定的工作站可以托管多个公司（JR和/或私人公司），或者不同公司的工作站可以位于其他公司的旁边。东京也有两个独立的地铁系统，这增加了混乱。意识到这一事实将大大减少您试图理解铁路地图并找到解决方法的困惑。
通常，游客会惊讶地发现，与其他形式的大众运输工具一样，日本的火车几乎总是按照预定的发车时间赶到并及时到达。如果您迟到了，您一定会错过火车的！
大多数火车都不24小时营业；例如，在东京，它们不是在凌晨01：00-05：00运行，而新干线也从来不会在一夜之间运行。如果您打算迟到并依靠火车回家，请确保找出末班车的发车时间。许多酒吧和夜总会一直营业，直到第一班火车在早上再次开通，因此，请记住这一点作为另一种选择，或者在24小时营业的网吧中收拾东西。唯一的例外通常是在12月31日晚上，因为一些公司在通宵拜年新年神社时提供火车服务。
寻找路线
无论您是刚刚开始计划旅行还是已经在乡下，路线搜索引擎都是一个绝佳的工具。为了对运输时间表和票价进行分类，HyperDia是无价之宝。它可以计算最新的方向，包括火车，公共汽车和飞机。Jorudan是一项类似的服务，但探索替代路线的选择较少。Google Maps非常适合地铁和城市火车出行，但对于长途旅行而言，其搜索选项和所显示的路线用处不大。JR-EAST火车信息是一个应用程序，可显示火车连接信息，直至车站的站台号。该应用程序仅显示JR东线的地图，但可以为全国的火车线路提供指导。
这些的纸质版本是Daijikokuhyō（大时刻表），它是电话簿大小的书本，可以在每个火车站和大多数酒店中浏览，但使用的内容完全是微观的日语，使用起来有点挑战。日本国家旅游组织的海外办事处可以提供较轻的版本，仅包括特快列车，卧铺列车和子弹头列车（新干线）。可以在JR北海道，JR东，JR中部和JR九州的网站上找到英语时间表。东海道，山阳和九州新干线的时间表也可以在Tabi-o-ji以英语查看。
HyperDia和Tabi-o-ji提供时间表搜索，以查找可以使用Japan Rail Pass（参见下文）的路线，而Jorudan则需要付费。只需取消选中或选择排除Nozomi和Mizuho火车的选项即可。（HyperDia的选项也将Hayabusa火车排除在外，尽管自2011年以来就允许使用JR Pass。）HyperDia也是唯一可以搜索与Seishun 18票兼容的票价的火车（请参见下文）。
智能卡
任何来日本的游客都应该做的第一件事就是拿起公共交通智能卡（スマートカードsumātokādo），也称为IC卡（ICカードaishīkādo）或jōshakādo（乘车カード，“登机卡”） 。使用智能卡可以自动计算票价，无论您的旅程多么复杂或您转机的频率如何；只需在两端轻按，然后轻按即可。除了公共交通以外，智能卡也越来越多地用于各种电子支付，因此可以在自动售货机，便利店，快餐店等处使用智能卡。
以下列出的十种主要卡可以完全互换，这意味着您可以在任何主要城市提取一张卡，并在几乎整个国家/地区使用它，主要的例外是四国和冲绳。从北到南，按地区划分是：
北海—北海道
Suica-东北和关东
PASMO-东京
TOICA —中部
马纳卡—名古屋
ICOCA-关西和中国
PiTaPa —关西—与您（日本）银行帐户关联的后付卡，因此对于大多数来自国外的访客而言，该卡无用
SUGOCA —九州
Hayakaken —福冈
nimoca —福冈
这些卡可以在任何车站的售票处购买和充值，包括机场的售票柜台和许多自动售货机，基本押金为¥500加上您希望装载的金额。当您离开日本时，押金和任何剩余价值都可以退还，或者您可以保留该卡以备下次访问，因为它们的有效期为10年。
您不能使用智能卡本身在常规火车上的两个不同区域之间旅行。例如，如果您要开始在东京的旅程，然后使用JR东海道线向西行驶至热海，则可以使用智能卡，因为这些车站都在东日本铁路（JR East）的边界内。但是，如果您继续沿着热海向静冈方向行驶，那么您将进入一个由另一家公司运营的区域-在这种情况下，是日本中部铁路（JR Central）-并且当您尝试从系统中取出卡时，您的卡将不被接受。 。在两个地区之间旅行需要纸质票，但是即使在售票机上也可以接受智能卡作为付款（您的纸质票上会印有IC字母）。
自2017年9月以来，智能卡已被允许在东海道和山阳新干线旅行，代替纸质机票。子弹头火车票可以用信用卡在线购买，并与智能卡绑定，该智能卡可用于进入和退出检票口。该服务提供英语和日语两种语言。
买短途票
在某些情况下，您可能仍需要购买纸质火车票，例如，从一个地区穿越到另一地区时，或者在尚未接受智能卡的偏远地区。
日本大多数火车票都是按距离定价的，因此在售票机上方会有一张地图。在中心附近，通常将当前电台标记为“駅”（tōeki）。您可以在附近找到价格低于其价格的所有其他车站。较近的车站的数量较少（例如，较近的车站的票价可能约为140日元，较远的车站可能会升至2,000日元）。只要您使用的是同一轨道系统，就可以选择任意路线，并在火车之间免费换乘。
要购买车票，请将硬币或现金插入自动售票机。在执行此操作时，您可以用该笔钱购买的门票照亮。通常，您只需要购买正确数量的普通车票即可，但是对于某些旅程，您可能需要购买中转票价或其他一些特殊选择。
硬币槽很大，因此您可以一次插入多个硬币。一个诀窍是将整个零钱包丢进去。无论您找回什么零钱，都将使用最大的硬币，从而减少您携带的零钱（讨厌的1日元或5日元硬币除外，这些硬币通过的机器不接受付款）。
将车票插入票价门，当您通过后别忘了将其领取。不要扔掉票。您在旅途结束时退出检票口时必须再次插入。
如果您无法确定价格，请购买最低票价的机票，然后在到达目的地时付款。您可以在登机口向工作人员出示票证，或在“票价调整”机上支付余额。在出口检票口前寻找一个小型售票亭。插入您的最低票价，并支付屏幕上指示的余额。
在无人站
在日本农村，有很多无人值守的车站（火车站）（在山手线或大阪环线都找不到），在那里您会受到一个没有其他平台的欢迎。对于配有检票口和自动售票机的无人值守站，您应该像有人值班一样继续操作。
与搭乘日式巴士类似，您的火车应指定火车的出入口。查找“ワンマン”和/或“后乘前降”之类的词，这意味着入口在后面，出口在前面。
登上火车时：
如果您有，请点击您的智能卡。
如果您打算使用JR铁路通票，或者已经购买了票，则可以正常登车
如果您没有车票，则应该在登上火车时获得一张编号为票据的票，或者根据情况从火车上的售票员那里购买车票。编号的票证记录了您的始发站，如果您没有/丢失票证，可能需要支付最贵的票证价格。
在无人值守的车站离开火车时：
如果您有，请点击您的智能卡。
将您的铁路通票显示给售票员，如果使用JR铁路通票，请轻按。如果您的旅程超出铁路通票的预付区域，则售票员将通知您要支付多少。
如果您已购买机票，请交出机票。
退回已编号的机票，如果您搭乘已编号的机票，则需支付机票价格。火车出口处将显示票价表，您应该使用硬币支付车票。不会有任何变化。
将火车放在有人值守的车站时，如果您使用票证，智能卡或火车通票，则可以正常离开。如果您使用带编号的机票旅行，则应该交出带编号的机票，并在目的地的手动检票口支付机票价格。
最后，服务于农村地区的较旧的火车使用手动火车门，登上/离开火车时，您必须打开火车的门，而且很难打开。如果您无法打开火车的门，请寻求他人的帮助。
JR网络
正如人们所期望的那样，JR网络是一个庞大的网络，曾经是国家铁路系统。JR集团经营新干线以及许多区域和城市的公交线路。在农村，集团公司还经营公共汽车服务，以连接没有铁路服务的地方。但是，JR网络不是垄断企业，特别是在主要城市中，还有其他私有铁路网络。
有趣的是，人们用日语的英文缩写jēāru来指代JR。希望甚至会说英语的人也可以在您询问时帮助您找到电台。
日本铁路通票
到目前为止，对于打算进行大量旅行的游客来说，最佳选择是日本铁路通票，该通票允许几乎所有JR列车（包括新干线）无限制旅行，并且可以在私人铁路的某些路段旅行（请参阅以下例外）。固定期限为7、14或21天。
为了获得日本铁路通票的资格，您必须是作为旅游者来日本旅游的外国人（在您的护照上有临时访客印章），或者是在日本境外居住了至少十年的日本人。
您可以在出发前往日本之前或之后购买日本铁路通票。可以直接从Japan Railways在线（通过JAPAN RAIL PASS预订网站）或通过在日本兑换成通行证的旅行社出售的代金券在线进行预购。您可以在到达日本后至少2021年3月31日购买日本铁路通票。居住在国外的日本国民必须通过凭证系统获得铁路通票。居住在国外的日本国民至少可以在2023年12月31日之前购买兑换单。
您必须在JR大车站的有人值守的售票员那里出示护照，以领取Japan Rail Pass。如果是提前购买的，则您需要出示购买证明（如果通行证是通过JR购买的）或交换凭证（如果是通过旅行社购买的）。如果要交换代金券，则必须通知票务代理您希望铁路通票开始的日期。羽田机场，成田机场和关西机场等主要机场均设有专门讲英语的柜台。在主要的JR车站，例如东京，新宿，上野，名古屋和札幌，也设有专门用于铁路通票的柜台。
与以前的纸质版本不同，日本铁路通票采用实际磁火车票的形式，带有用户唯一的印刷QR码。您可以在进出火车站时使用车票通过自动售票口。
铁路通行证包括符合条件的JR火车的免费座位预订，其中包括大多数新干线和特快列车服务。如果您是通过JR预先购买的通票，则可以在购买通票后立即进行在线座位预订。一旦获得了铁路通票，便可以使用预订的售票机在JR车站进行预订座位的预订或收集。您可以通过扫描印在铁路通行证上的QR码（或输入通行证上印刷的识别码）然后输入您的护照号来访问机器。即使在线预订座位，上车前也必须在售票机上和您所有的地方打印出实际的座位预订票。请注意，对于自动化系统，座位预订链接到每个单独的铁路通票，并且您将不允许预订彼此重叠的服务。通常这不是问题，但是如果您错过了预订的火车，则可能无法立即预订下一个出发点。对于无保留的座位，不需要门票。当售票员通过检票时，只需出示火车通票即可。
由于交换凭证系统将继续存在，至少到2023年年底，由于价格会更低，因此仍然有必要购买凭证而不是直接从JR订购。另一方面，如果您需要在抵达日本之前预订特定的火车服务，则可能值得提前购买通票。通过JR购买的通行证必须在购买后的一个月内开始，而优惠券可以在购买后的三个月内进行兑换。
铁路通票确实有一些例外：
如果您乘坐东海道，三洋或九州新干线旅行，则日本铁路通票不允许乘坐更快的Nozomi或Mizuho服务-您必须支付全额车费和座位费。搜索引擎（例如Hyperdia和Tabi-o-ji）可以选择排除这些火车，而Google Maps和其他则没有。
JR东日本的新干线网络上的许多新火车都有称为“ GranClass”的高级头等舱。除非您支付特快和GranClass附加费（即如果从东京一直到函馆，从Hayabusa缴纳27,220日元），否则您不能将GranClass客舱与任何日本铁路通票一起使用。
对于在非JR拥有的轨道上行驶的JR火车，您必须支付额外的附加费。一些示例包括：
大崎和新木场之间的东京滨水铁路临海线，用于连接台场
伊豆半岛伊东至下田的伊豆急铁路
从福知山到丰冈的京都探戈铁路，这是从京都到天桥立的JR火车使用的
如果您呆在私人隔间内，则可在大阪和福冈之间搭乘通宵列车和少量新干线列车，但必须支付特快和住宿费用。
包括一些额外功能：
如果在以下路段没有中途停留，JR通行证涵盖往返于私人铁路上隔离的JR铁路的旅行：
青森铁路的八户和野河间之间，青森和野间之间，八户和青森之间，可通往JR大凑线。
在IR石川铁路的金泽和椿之间，可乘坐JR七尾线。
在爱乃风富山铁路的富山和高冈之间，可乘坐JR约翰娜和冰见线。
JR Pass包括从羽田机场到东京滨松町的东京单轨铁路旅行，包括中途停留。
JR通行证包括乘坐JR渡轮前往宫岛的旅行。
区域铁路通票
地区JR公司还出售自己的通行证，仅覆盖该国部分地区。它们的价值通常较差，您必须仔细计划才能使它们得到回报。从北到南：
北海道：JR北海道铁路周游券
东北：
JR东铁通票-东北地区（还包括关东和一些私人铁路线）
JR东南北海道铁路通票（包括东北通行证覆盖范围，北海道新干线至函馆市和JR列车至札幌市）
关东：JR东东京宽幅通票（还包括一些私人铁路线）
中部：
JR东/ JR西北陆拱门通票–涵盖了经由北陆地区在东京和关西之间的旅行，还涵盖了一些私人铁路线
JR东铁通票–长野/新泻地区（还包括关东和一些私人铁路线）
中国：JR West销售几种，包括：
关西广岛地区通票
San’yo-San’in地区通行证
关西广域Pass
四国：所有四国铁路通票（还包括私人铁路线和有轨电车），四国西九垦基普
九州：所有九州地区通票，九州北部地区通行证（涵盖熊本市和大分县以北的地区）
许多JR East和JR West铁路通票可以在网上预先购买，折扣价在500-1,000日元之间，而在国内时，必须购买其他通票。
青春18门票
Seishun 18票（青春18きっぷSeishunjūhachikippu）是日本旅行中最经济的机票，提供为期5天的无限制火车旅行，价格仅为12,050日元。更好的是，与铁路通票不同，日子不必是连续的。您甚至可以拆分票证，以便（例如）一个人使用2天，另一人使用3天。主要发现是票仅在当地火车上有效，并且票仅在学校假期期间有效（3月至4月，7月至9月，12月至1月），因此您需要良好的时机和大量时间来使用它。
买长途车票
标准JR门票通常分为两类：
基本票或乘车券：这些票包括在两个车站/区域之间运营的火车的基本票价。长途旅行允许中途停留，尽管您必须停留在售票路线上并且不能回溯。对于超过100公里的旅程，门票有效期为2天；对于超过200公里的旅程，门票有效期为3天；之后每增加200公里，门票有效期为一天。
特快票或tokkyūken（特急券）：名称上有几种变体，可以购买包括新干线在内的高级长途列车的特快票。通常，未预订（自由席jiyūseki）的票对任何服务的未预订席位有效，而预订（指定席shiteiseki）的票对特定火车有效。
在主要车站，会有一个明显的旅行区，您可以在这里从人类那里买票；寻找坐在椅子上放松的人物的绿色小标志，或者索要midori no madoguchi（点亮绿窗的みどりの窓口）。因为您可能需要知道火车时间，并且可能还想保留一个座位，所以这是一件好事。一般来说，如果工作人员不会说英语，您可以通过挥手和指向目的地来表达自己的愿望。写下信息有帮助，因为大多数日本人读英语比听英语要容易得多。
对于需要额外收费和预订座位的特快列车，通常可以找到配备人工的窗口。但是，某些火车具有自己的特定机器来执行此操作。首先，购买前往目的地的普通火车票。在触摸屏机器上，通常会有一个用于快递服务的按钮。选择您要乘坐的服务的名称，目的地，首选出发时间和座位偏好，然后输入附加费。您将获得一张预订卡，显示出发时间和您的座位号。您还必须具有旅行票证，通行证或智能卡才能通过检票口：单独收取附加费对旅行无效。
通用自动售票机正变得越来越普遍。这些机器可以显示英语，并且可以为已预订和未预订的座位发行长途票价票和特快票。它们通常位于售票窗口附近。在购买车票时，请注意显示的路线，因为您必须沿着售票路线行驶（不允许在该路线以外中途停留）。
对于未预订的当地火车，只需使用您的智能卡即可。如果票价恰好超出了您在卡上的余款，您可以在目的地车站的售票柜台或票价调整机上支付差额。但是，如果您的旅程跨越了不同运营商的边界，则可能会导致您的智能卡不被接受。此外，某些工作站没有智能卡读取器。通常可以在不同铁路公司的边界附近或发卡行网站上找到此类限制的详细信息。建议长途旅行时始终在售票机或售票处购买票价。此外，这样做可能使您能够购买到最终目的地的票价，并在两者之间进行中途停留，
游客最可能遇到的边界如下。尽管存在其他界限，但普通旅行者不太可能用IC卡越过它们。
JR东日本和JR中部之间的边界位于热海和关南之间。该边界位于东京和三岛之间的东海道干线上。
JR Central和JR West之间的边界介于关原原和三原之间。这也是名古屋和京都之间的东海道干线。
如果您碰巧错误地使用了智能卡，您将在目的地支付车费，车站工作人员或售票员会给您写一些证明，证明您将带他们到附近的车站或始发车站以使他们解锁您的卡。
火车类型
JR开创了著名的子弹头列车，其日语名称为新干线。这些服务的时速高达320 km / h（在不久的将来为360 km / h），被称为“超特快”（superexpress），并且仍然是在全国各地旅行最快的方式。请注意，新干线并非一夜之间运行。新干线也以其令人羡慕的安全记录而闻名，自1964年开始运营以来，没有发生过一次导致乘客死亡的事故。
东海道/山阳/九州新干线
该国最重要，旅行最多的新干线是连接东京与名古屋，京都和大阪的东海道新干线。这条线从大阪一直延伸到冈山，广岛和福冈（博多站）作为山阳新干线，然后再到达熊本和鹿儿岛，成为九州新干线。
东海道，山阳和九州新干线共有六种不同类型的服务。这些都可以分为三种类型，反映了已停止的次数：
M（Noぞみomi），瑞穗（みずほ）
这两项服务最快，仅在主要城市停靠。除了新干线车费外，还需要支付少量附加费，并且火车上除三辆车外的所有车厢都必须预订座位。对于游客而言，最重要的是，日本铁路通票不适用于Nozomi或Mizuho火车。
Nozomi是贯穿东海道和山阳新干线的主要服务，尽管其他一些Nozomi列车仅在东京和大阪之间运行。这种火车类型在工作日提供每10分钟一班的频繁服务，并开行16辆车。从东京到大阪的Nozomi单程旅行需要2小时30分钟，而从东京到福冈的旅行则需要5小时。可以在福冈市之间乘坐Nozomi和Kyushu Shinkansen火车进行无缝换乘：东京到熊本为6小时，从东京到鹿儿岛的全程大约为7小时。
另一方面，瑞穗号仅在大阪和鹿儿岛之间的三洋和九州新干线提供服务，旅行的早晚是高峰时间。瑞穗列车从大阪到熊本仅需3小时，而鹿儿岛则需3小时45分钟。瑞穗列车仅运行8辆车，并在6辆车上共享后备座位和绿色座位。
ika（ひかり），樱花（さくら）
这些是使用日本铁路通票有效的最快服务，比Nozomi或Mizuho多了几站。在东海道新干线上，每小时通常有两班光明火车从东京出发：一列火车在大阪终止，另一列在山阳新干线继续，终止于冈山。在大阪市西部，每小时通常有一趟樱花列车（通勤时间为两趟），从大阪到福冈再到鹿儿岛。其他樱花服务仅在九州新干线的福冈，熊本和鹿儿岛之间运行。
如果您将Hikari或Sakura与Japan Rail Pass一起使用，通常需要至少转移一次才能长途旅行。对于东海道和山阳新干线的旅行，最佳的转乘地点是新大阪的候机楼。您也可以考虑在新神户（Shin-Kobe）进行换乘，在那儿，火车可以到达并在同一条轨道上出发。根据时间表，最好在姬路或冈山进行更改，因为它们提供相同的平台更改。
乘坐这些服务从东京出发，可以在3小时内到达大阪，在6小时内到达福冈，在7小时内到达熊本，在8小时内到达鹿儿岛。从大阪出发，您可以在3小时内到达福冈，在3小时30分钟内到达熊本，在4小时15分钟内到达鹿儿岛。
小玉（こだま），燕（つばめ）
这些也适用于“日本铁路通票”，是该路线上每个新干线车站都停止的全站服务。Tokaido Shinkansen Kodama服务通常从东京到大阪，从东京到名古屋。在San’yo Shinkansen上运行单独的全站式Kodama服务，而Subsub列车仅在Fukuoka，熊本和鹿儿岛之间的Kyushu Shinkansen上运行。东海道儿玉列车运营16辆车，而山阳儿玉和九州燕社的列车可能会更少，因此请务必检查平台上的标志，以确保您的登船地点正确。
其他新干线路线
日本的其他子弹头列车路线主要由JR东日本运营，并辐射到东京车站以北。这些包括：
东北新干线到仙台，盛冈和青森，继函馆之后成为北海道新干线
秋田新干线到秋田，再加上东北新干线火车到盛冈
山形新干线到山形和新庄，再加上东北新干线火车到福岛
上越新干线到汤泽和新泻
北陆新干线到长野，富山和金泽
日本铁路通票对所有这些服务均有效，但在某些路线上运行的GranClass客舱除外（需要额外收费）。
其他JR火车类型
其他JR服务（尤其是郊区服务）使用以下通用标签：
普通/本地（普通futsū，各停kakutei或各駅kakueki）–在每个车站都停靠
Rapid（快速kaisoku）–在3个停靠点中跳过大约2个，不收取附加费
Express（急行kyūkō）–在3个站点中跳过大约2个站点，需要附加费（与当地人和急流市相比，如今在JR上较不常见）
班轮（ライナーrainā）–跳过3个kyūkō站中的大约2个，需要附加费
特急（kk）–在3个kyūkō站中跳过大约2个，需要附加费，通常还需要预留座位
绿色汽车
快递服务可能会提供一流的Green Car（Carリーン车guriin-sha）座椅。鉴于几乎50％的附加费仅给您一点额外的腿部空间，因此大多数乘客都选择常规座位。但是，如果您确实需要乘坐常规座位已满的特定火车，则可以选择绿色汽车。JR通行证有两种类型：“普通”（需要支付使用绿色汽车的附加费）和“绿色”（其中包括免费的绿色汽车座椅）。
取决于您在日本旅行的地方，“绿色汽车”确实有一些好处。在高级Nozomi和Mizuho（不适用于铁路通票）上，您会遇到一位女服务员，她会在您进入火车时向您鞠躬，并代替火车票务员检查车票。根据您旅行的日期和时间，绿色汽车可能比普通汽车少拥挤和安静，但是，当然，在黄金周和其他高峰旅行期间，所有赌注都关闭了。
大类
在日本东部和北海道的子弹火车网络上运行的大多数火车（由JR East和JR北海道运营的火车）都提供称为GreenClass（グランクラスguran-kurasu）的优质绿色舱体验。该服务可等同于航空公司的国际商务舱，并以2 + 1配置提供18个宽大的，可倾斜电源的“壳体座椅”。
GranClass提供最快的服务，可为您提供私人的机舱服务员，更多的软饮料和酒精饮料选择以及使用当地食材制成的优质食品。在高峰时段和傍晚时段，GranClass也可能会提供速度较慢的停车服务，但不会提供食品和服务员服务。
这些服务采用特殊的GranClass票价结构。日本铁路通票和JR东铁通票的持有人需要支付特快票价和GranClass票价才能乘坐GranClass旅行。即使您拥有绿色汽车通行证，它仍将仅涵盖基本票价-但是，配备GranClass的火车也提供常规的绿色汽车通行证，绿色汽车通行证可免费使用。
抽烟
日本许多铁路公司都已在平台和火车上限制或禁止吸烟。
只有极少数的长途服务和子弹头列车将吸烟者的车厢分开，包括一些正在使用的较旧的子弹头列车。包括新的和翻新的子弹头列车在内的大多数其他汽车，都将吸烟者限制在某些汽车之间的小型通风房间内，这些房间被称为“吸烟角”。所有的郊区和通勤服务，以及许多长途火车，都根本禁止吸烟。
通常，在时间表上，无烟火车上都标有通用的禁止吸烟标志，或带有日本汉字的禁止吸烟标志（吸烟）。
食品与饮品
乘坐新干线或长途特快列车时，最好在上车前购买任何食品或饮料以备食用。
考虑购买ekiben（駅弁），这是在火车站出售的打包餐点，打算在火车上食用。每个大型车站都有几个出售ekiben的摊位，甚至中型车站通常也会有一些摊位。每个ekiben都不一样，代表包装时所在地区的口味。新干线的一些主要车站，例如东京和新大阪，将开设全国各地销售ekiben的商店。对于日本人来说，在啤酒或日本清酒中拿起ekiben并在火车上开一个小型派对是很常见的，您可以很乐意采用这种习俗。
一些主要车站的车站候机厅内或什至在车站本身的平台上都会有餐馆或速食餐厅，您可以在上车前先吃点东西。例如，在名古屋的新干线平台上，有几家面条店，距离子弹头列车驶入的地方仅几步之遥。
某些服务仍然可以提供车载食品和饮料的销售，尽管这种情况一直在下降，特别是在JR服务上。如果火车上确实有就座餐饮服务，那么通常会有很多ekiben可供选择，但通常比车站上的价格更昂贵，而且限制更多。
常规的通勤火车不允许饮食。一般来说，如果您自己的座位上有桌子，则可以在火车上吃喝玩乐。
预约
在新干线和tokkyū火车上，一些车厢要求乘客提前预订座位。例如，在东海道新干线的16车Hikari服务中，只有五辆车允许非预留座位，所有座位均禁止吸烟（吸烟车kinenensha）。在繁忙的火车上，提前预约可以确保旅途舒适。如果您是成群结队旅行，尤其要考虑这一点，因为您不太可能在繁忙的火车上一起找到2个座位，更不用说增加两个座位了。
预订非常容易，并且强烈建议您进行热门旅行（例如，星期五晚上从东京到京都旅行，或者从名古屋到高山乘坐火车）。请注意火车站的JR办公室，那里有一个坐在椅子上放松的数字绿色徽标，并在购买车票时要求进行预订。可以从火车提早一个月到字面上的几分钟进行预订。请注意，这些办公室的开放时间（专用于长途旅行）比本地火车的开放时间更为有限：它们可能在清晨或深夜关闭。
如果您是日本铁路通票持有人，则可以免费预订：只需前往JR办公室，并在要求预订旅程时出示您的铁路通票。不过，您所获得的票将不允许您通过自动道闸-您仍然需要在有人道闸上出示日本铁路通票才能到达火车。
如果没有通行证，将收取少量费用，因此，非保留票可能比保留票更可取，特别是如果您在东京或其他始发站登机，而所有座位均会开放。
在线预订
外国人可以使用几种在线服务来预订许多英语和其他几种语言的JR列车。这些预订服务比往年要多，但必须注意的是，每种服务都有其优点和缺点。
SmartEX
SmartEX App允许通过移动设备在线预订东海道和三洋新干线子弹头列车（即东京，名古屋，京都，大阪，广岛和福冈之间的服务）。注册并提供有效的信用卡后，可以购买这些专线的子弹头火车票。旅客可以在登机前在自动售货机上购买保留的票，或者使用有效的IC卡来进出新干线系统。SmartEx App可让用户从普通机票中享受¥200的折扣，并视情况而定提供其他折扣的“ Hayatoku”票价。可以在火车预定发车时间前一个月到四分钟进行预订。但是，如果您拥有日本铁路通票，则没有任何保留的条款。
JR东日本火车预约服务
JR东日本火车订票网站允许普通旅客和铁路通票持有人都预订以下服务的座位：
除东海道，三洋和九州新干线外的所有新干线列车
主要的JR东日本特快列车，包括成田特快列车，往返东京
所有JR北海道特快列车
札幌新千岁机场往返机场快速列车
您可以在旅行开始前一个月至三天的任何时间在JR East的网站上预订座位，并且您的机票必须在出发前一天的21:00之前的任何时间在JR East售票柜台领取。另外，除非您有有效的铁路通票，否则基本票价不包括在座位预订费用中。
如果您在东京，还可以利用羽田机场，成田机场和六个主要火车站的面向外国人的JR东日本旅行服务中心。您可以轻松地与会说多种语言的工作人员交换火车通行证，购票或预订座位。仙台站也有另一个这样的中心。
JR西铁预约服务
JR西列车预订网站允许用户预订以下服务的座位：
东海道，三洋，九州，上越和北陆新干线的所有服务
东京与那须盐原之间的东北新干线服务（不包括北至福岛，仙台，秋田，北海道等的服务）
四国和九州的岛屿（在JR Central，JR West，JR Shikoku和JR九州经营的地区）在日本中部和西部的所有特快服务
东京及关东，中部和东北地区部分地区（由JR East经营的地区）的特快服务
也可以通过JR West服务购买地区JR West铁路通票和旅行产品。
可以预订直到起飞前几分钟。可以用信用卡提前付款，也可以亲自领票时以日元（现金）付款。可以在以下位置取票：
日本中部或西部的任何售票处或售票机，显示e5489（ii go-yoyaku，“电子预订”的双关语）预订系统符号
东京或仙台的JR东日本旅行服务中心，但通过东急新干线等JR中部地区的火车除外。
如果您要购买仅限外国游客的区域铁路通票或车票，则必须在日本西部的JR West站取车。您可以去e5489售票处，或者如果您有带IC芯片的护照，则可以去往配备有护照阅读器的e5489票务预订机。
如果您使用JR West预订服务从东京的Tokaido新干线预订了车票，则需要前往Tokyo Station或Shinagawa Station并前往JR Central售票处或e5489预订机来接收车票。
九州铁路周游券预约服务
九州铁路通票预订网站允许外国旅客购买九州铁路通票，并且允许九州铁路通行证持有人在九州的火车上预订座位。
行李
在所有子弹头列车和特快列车上，都有一个高架，可以存放个人物品和小行李。尽管出于个人空间和舒适性考虑，通常不建议携带大行李，但为了自己和其他乘客，每辆车后部的空间有限，无法容纳几个大行李箱。除了在火车上携带大件行李外，您不妨考虑行李运送服务，在日本，这是一种高效且经济的行李运送方式。例如，一个20公斤（44磅）的行李箱长度，宽度和高度总计不超过140厘米（55英寸），在大和的Ta-Q-Bin（宅急便takkyūbin）之间在东京和京都之间运输时，大约要花费1700日元。 ），第二天发货。长途送货（即 东京-福冈（Tokyo-Fukuoka）可能需要两天，并且必须多加一天才能送达机场。大多数酒店和便利店将能够为您做出必要的安排并接受付款。
少数子弹列车正在安装行李架，以响应海外游客的旅行：在东京和富山/金泽之间运行的大多数北陆新干线列车都在偶数标准级车和绿色车中安装了行李架。
行李预订
东海道，三洋和九州新干线要求所有携带大件行李的乘客进行特殊座位预订。这种预订在购买机票时无需支付任何额外费用，可使携带大行李的乘客在预订的汽车后排保留座位并将行李存放在座位后面。那些没有特别预订的人将被要求将行李寄存在汽车之间的指定空间，每件行李的费用为¥1000。
私人铁路
如果有选择的话，在同等的旅程中，私人铁路通常比JR便宜。但是，并非总是如此，因为从一个网络更改为另一个网络通常会增加价格。大多数私人铁路都连接到同名的百货连锁店（例如东京的Tokyu），并且在填补主要城市郊区的空白方面做得很好。私人铁路对上述服务等级的解释可能有所不同，有些铁路公司提供免费的快速服务。
神户，京都，名古屋，大阪，札幌，仙台，福冈，东京和横滨也有地铁（地下）服务。为了参观特定城市的景点，许多人都提供一日通行证，成人通常为¥500至¥1000。东京有几种类型的一日通行证，其中包括一些地铁线路，但不包括其他地铁线路。完整的东京地铁通票（不包括JR山手线）为¥900。
此外，第三部门铁路公司是建立为经营铁路线的私人铁路，铁路线是另一家铁路公司的财产（多数是JR集团的无利可图的铁路线）。其中，指定的本地线路服务是服务于日本大部分农村地区的无利可图的通勤铁路。由于这些公司大多数都是无利可图的，因此它们通常会为旅行者提供大量的服务，以吸引乘客。
优质服务
一些私人铁路运营特快列车，在主要城市和旅游/休闲目的地之间旅行。这些火车具有独特的外观，通常设有舒适的，可全保留的座位，并有一定的停留次数。有些通过自动售货机，座位售货车销售或车载咖啡厅提供餐饮服务。所有这些高级服务都需要在正常车费之外额外收取费用，例如JR列车的tokkyu-ken。
这些优质服务包括从新宿到箱根的小田急铁路的浪漫车，从浅草到日光和鬼怒川的东武铁路的SPACIA和Revaty，以及从池袋到秩父，从新宿到川越的西武的红箭和拉维尤。在日本中部，近铁在名古屋和大阪之间以及从名古屋，京都和大阪到伊势，鸟羽，志摩，奈良和K原等目的地提供过大量的限时快递服务，其名称为Shimakaze，Hinotori和Urban Liner。在关西，京阪铁路在京都和大阪之间运行的最快通勤列车上运行了一辆高级车，并预留了座位。
小田急，东武和近铁等越来越多的运营商现在在各自的网站上以英语提供在线预订优质火车的服务。
女士专用车
为了给女性乘客提供安全感，日本的许多JR和私人通勤铁路线都只在早上和晚上的高峰时段为女性预订汽车。这些汽车在火车和月台上通过特殊的标语和贴纸来标识，这些标志和标识还表明女性专用汽车生效的时间。另外，JR West往返关西地区的部分特快列车还预留了专门为妇女及其子女而设的座位。您会发现男人坐在“仅女性”座位上，但如果有要求，他们会让位。通常，在早上高峰时间，第一个和最后一个车厢被指定为“仅限女性”。
一些铁路公司的确允许残疾男子及其照顾者登上仅限女性的车厢，以及男性小学生。
隔夜乘火车
在日本，带有前缀shindai（寝台）的隔夜火车曾经是整个国家的标志，但由于卧铺车的蓝色而被人们普遍称为Blue Trains。许多服务将定期运行，从而将旅客及时，有效地带到该国不同地区。但是，如今，随着老化的火车设备和其他运输方式变得更容易，有时甚至更便宜（例如，新干线火车和通宵巴士），通宵火车已逐渐停产。
今天只有每日通行的通宵列车：日出出云（Sunrise Izumo，サンライズ瀬戸）和日出濑户（Sunset Seto，サンライズ瀬戸）。这些服务在东京和冈山之间共同运行。在冈山，汽车分流/合并，日出出云继续驶向仓敷和出云，日出濑户向南驶往四国岛上的高松。可以在冈山进行往返广岛和九州等地的子弹头列车接送服务。
使用这些服务时，必须另外付费。基本票价和特快附加费均基于距离，住宿费在整个旅程中是固定的。住宿范围从地毯空间（实际上是您在地板上睡觉的地方）到双层床型隔间和私人房间。整个火车上都有洗手间，您可以在特殊的自动售货机上购买淋浴卡，以支付少量费用使用车载淋浴-但每次旅行只能使用数量有限的淋浴卡。
日本铁路通票仅涵盖基本票价。如果您睡在双层床或私人房间中，则必须支付特快和住宿费用。另一方面，如果您在地毯上睡觉，则被视为“预留座位”，使用该座位无需额外付费。
在需求旺盛的时期，例如黄金周，新年和夏季，还增加了一些额外的过夜服务。其中包括东京和大垣之间（位于名古屋和京都之间）的非常受欢迎的Moonlight Nagara（ムーンライトながら）服务。Moonlight Nagara和某些其他额外服务被归类为带有常规座位的快速列车。因此，这些火车可以与Seishun 18车票一起使用-跑步时往往会很拥挤。
过夜火车旅行有一些弊端。在大多数情况下，您只有在到达日本后才能预订火车，届时火车可能会被抢购一空（除非有帮助的日本居民在抵达日本之前为您购买了火车票）。如果预计沿途天气恶劣，一些通宵列车也将在出发日期当天取消。
除了乘火车过夜外，也可以乘坐巴士旅行-但是，如果您拥有日本铁路通票，则还有另一种夜间旅行的方式，而且相对容易。关键是分散您的旅程，在到达目的地的中间车站停下来，然后在附近的（最好是便宜的）旅馆休息。早晨，乘另一趟火车前往您的目的地以完成旅程。铁路通票将涵盖您的火车旅程；您唯一的责任是支付酒店房间的费用。如果您可以在较小的城市中找到住宿，那么与在东京等较大的城市中相比，住宿的机会就更少了……更不用说您将拥有自己的床，浴室和卫生间。
如果您有多余的钱，请考虑使用行李运送服务将一些行李运送到目的地。
豪华游览火车
许多短途旅行火车被称为“快乐火车”（ジョイフルトレインjoifuru torein）。截至2020年，您可以通过搜索“快乐火车”找到多达50列此类火车。有些只是风景优美的普通游乐设施，而有些则具有有趣的功能，例如榻榻米垫座位，美术馆，以当地食材制成的甜食或足浴。还有一些一般针对孩子的角色火车，例如带有游戏室汽车的神奇宝贝火车，上面装饰着大约一百万个皮卡丘。
各种日本铁路公司都提供一些豪华住宿的卧铺火车。JR九州（JR Kyushu）于2013年推出了“九州的七颗星”，由于行程漫长而多样，他创造了这句话。九州的七星级酒店在九州适当运营，包含14间豪华套房，休闲车和餐车。
一晚的车费从210,000日元起，三晚的车费从480,000日元起，其中包括一间日式旅馆的住宿（每人两次）。尽管费用很高，但事实证明这种游览火车非常受欢迎，以至于JR九州（JR Kyushu）持有一张彩票，以确定谁可以订购门票。例如，在2015年10月至2016年2月之间，有210套房可用于火车运行，有6800多个申请。旅行社已开始为那些错过彩票的人加价出售这些路线。
由于九州七星酒店的成功，其他火车公司也纷纷效仿自己的短途旅行火车。JR East推出了豪华的Shiki-shima火车套房，可用于从东京到北海道南部的东北和函馆的旅程。JR West的Twilight Express Mizukaze经营关西和中国地区之间的行程。
伊豆急行铁路的皇家特快列车运营从横滨到伊豆半岛的游览活动。