As salas que compõem o apartamento no primeiro andar do Palazzo eram usadas pelos conservadores, ou magistrados, para atividades ligadas ao escritório; formam, portanto, uma única entidade, tanto no que diz respeito à sua função como às suas características ornamentais. As salas também foram usadas para reuniões do Conselho Público e Privado.

A rica decoração dessas salas de recepção (afrescos, estuques, tetos e portas esculpidas, tapeçarias) tem como tema principal a história da Roma Antiga, desde a sua fundação até a Era Republicana. O primeiro ciclo de afrescos remonta ao início do século XVI.

Salão dos Horatii e Curiatii
A decoração de afrescos desta grande sala foi realizada por Cavalier d’Arpino (Giuseppe Cesari) no final do século XVI e no início do século XVII.

Originalmente concebidos como tapeçarias para serem penduradas nas paredes, esses afrescos retratam episódios históricos da Roma Antiga, que também inspiram os medalhões monocromáticos abaixo.

Duas estátuas monumentais de papas se enfrentam nos dois lados menores da sala: a que retrata Urban VIII é em mármore e foi executada por Bernini e seus alunos, enquanto a estátua de bronze de Innocent X é obra de Algardi.

Salão dos Capitães
Os afrescos na parede, de Tommaso Laureti, datam do final do século XVI. Eles se referem ao início da era republicana e retratam episódios exemplares do antigo valor romano na forma de tapeçarias.

A sala também contém tábuas de pedra e estátuas de retratos que comemoram homens famosos e capitães da milícia pontifícia.

Salão de Aníbal
De todos os quartos do Palazzo dei Conservatori do século XV, este é o único quarto que manteve suas proporções originais.

A decoração com afrescos que remonta à primeira década do século XVI e tradicionalmente atribuída a Jacopo Ripanda comemora episódios das Guerras Púnicas em quatro cenas; embaixo, corre um longo friso com nichos contendo bustos de generais romanos.

O teto de madeira, realizado pouco depois da decoração com afrescos, exibe uma imagem esculpida da Loba Capitolina no centro.

Capela
A capela é dedicada a São Pedro e Paulo, santos padroeiros de Roma, retratados nos afrescos do teto que foram executados ao mesmo tempo que as decorações de estuque de Michele Alberti e Jacopo Rocchetti na terceira década do século XVI.

A pintura está em ardósia e mostra Nossa Senhora em glória entre os santos Pedro e Paulo, que colocam a cidade de Roma sob a proteção da Virgem. Pinturas retratando os quatro evangelistas e outros santos completaram a decoração da capela no século XVII.

Salão das Tapeçarias
O friso fresco, retratando cenas da vida de Scipio Africanus e embelezado com reproduções de estátuas antigas, foi realizado em meados do século XVI, ao mesmo tempo que o teto de madeira dourada e esculpida. No século XVIII, um trono foi instalado para ser usado durante as visitas papais e a sala foi decorada com tapeçarias da fábrica romana de San Michele e móveis ricamente esculpidos.

Os desenhos das tapeçarias de Domenico Corvi mostram episódios históricos e lendários da Roma antiga, reproduzindo pinturas de artistas importantes, incluindo Rubens e Poussin.

Salão dos Triunfos
O friso de afrescos que corre ao longo da parte superior das paredes foi encomendado por Michele Alberti e Jacopo Rocchetti em 1569.

Retrata o Triunfo de Lucius Aemilius Paullus sobre o rei da Macedônia Perseu, com o Capitolino e o Palazzo dei Conservatori em segundo plano.

O teto de madeira caixotado é o único que resta entre os executados no Palazzo por Flaminio Bolonger.

Esta sala também contém algumas grandes esculturas de bronze: o Capitolino Brutus, o Spinario e o Camillus.

Salão da Loba
Desde meados do século XVI, quando era uma galeria aberta de três arcos, esta sala continha a loba Capitolina de bronze, que se tornou o símbolo de Roma.

Embutidos nas paredes estão fragmentos de Fasti Consular e Triunfal, listas de magistrados e vencedores triunfais desde o tempo da república até a Era Agostesa descobertos no Fórum Romano e parte de um arco dedicado a Augusto.

A decoração pictórica da parede, que remonta à primeira década do século XVI e tradicionalmente atribuída a Jacopo Ripanda, é bastante fragmentada e difícil de decifrar.

Salão dos Gansos
As decorações pictóricas da sala datam de meados do século XVI, durante o papado do Papa Paulo III

O friso consiste em pequenos painéis, com cenas lúdicas em um cenário de paisagens reais ou imaginárias, alternando com troféus militares e triunfos florais e de frutas.

Os dois gansos de bronze que deram nome ao quarto foram colocados aqui no século XVIII, juntamente com um vaso de bronze em forma de busto de Ísis e uma cabeça de Medusa de Bernini.

Salão das Águias
O teto de madeira fina apresenta paisagens pintadas alternando com rosetas douradas esculpidas. O friso abaixo, do mesmo período do Salão dos Gansos, apresenta uma série de painéis retratando vistas de Roma e medalhões ovais mostrando episódios menores da história da Roma republicana.

Uma pequena estátua de bronze e mármore é uma réplica em pequena escala da estátua helenística do Templo de Ártemis em Éfeso, adornada com símbolos de fertilidade e cabeças de animais. Duas águias de mármore dão nome ao quarto.

Museus Capitolinos
Os Musei Capitolini datam de 1471, quando o Papa Sisto IV doou ao povo de Roma um grupo de estátuas de bronze que até então eram mantidas no Laterano. Essas estátuas constituíam sua coleção principal original. Vários papas posteriormente expandiram a coleção com obras retiradas de escavações em Roma; alguns foram transferidos do Vaticano, outros, como a coleção albanesa, foram comprados especificamente para o museu. Por volta de meados do século XVIII, o Papa Bento XIV criou uma galeria de imagens. Uma quantidade considerável de material arqueológico também foi adicionada no final do século XIX, quando Roma se tornou a capital da Itália e novas escavações foram realizadas, criando dois distritos completamente novos para a cidade em expansão.

As coleções dos museus estão expostas nos dois dos três edifícios que juntos cercam a Piazza del Campidoglio: Palazzo dei Conservatori e Palazzo Nuovo, sendo o terceiro o Palazzo Senatorio. Estes dois edifícios estão ligados por um túnel subterrâneo, que contém a Galleria Lapidaria e leva ao antigo Tabularium, cujos arcos monumentais dão para o Fórum.

O Palazzo Nuovo abriga as coleções de esculturas antigas feitas pelas grandes famílias nobres do passado. Seu arranjo encantador permaneceu substancialmente inalterado desde o século XVIII. Eles incluem as famosas coleções de bustos de filósofos e imperadores romanos, a estátua da Gália Capitolina, a Capitolina Vênus e a imponente estátua de Marforio que domina o pátio.

O apartamento dos conservadores contém o núcleo arquitetônico original do edifício, decorado com esplêndidos afrescos que retratam a história de Roma. Os antigos bronzes de Capitolino expostos aqui contribuem para a atmosfera nobre: ​​a loba Capitolina, Spinario e o Capitolino Brutus.

No primeiro andar do palácio, uma enorme sala de vidro, construída recentemente, contém a estátua equestre de Marco Aurélio, que ficava na Piazza del Campidoglio, e os imponentes restos do Templo do Capitólio Júpiter. Uma seção também é dedicada à parte mais antiga da história do Campidoglio, desde a primeira habitação até a construção do edifício sagrado, exibindo os resultados de escavações recentes. Os corredores que dão para a sala contêm obras dos Horti do Esquilino; o salão que liga a sala aos apartamentos do Palazzo dei Conservatori contém a coleção Castellani, testemunho das práticas de coleta do século XIX.

No segundo andar, a Galeria Fotográfica Capitolina contém muitas obras importantes, organizadas em ordem cronológica desde o final da era medieval até o século XVIII. A coleção inclui pinturas de Caravaggio (Boa Sorte e São João Batista), uma tela enorme de Guercino (Enterro de São Petronilla) e numerosas pinturas de Guido Reni e Pietro da Cortona.

O Palazzo Caffarelli-Clementino possui a coleção numismática, conhecida como Medagliere Capitolino. Em exibição estão muitas moedas raras, medalhas, gemas e jóias, além de uma área dedicada a exposições temporárias.