L’architecture de la Renaissance portugaise intimement liée à l’architecture gothique et progressive dans ses éléments classiques. Le style manuélin (vers 1490-1535) était un style de transition qui combinait les éléments ornementaux de la Renaissance et du Gothique à des bâtiments architecturaux plus proches de l’architecture gothique, tout comme le style Isabellin de l’Espagne. Manueline a été succédé par une brève phase de la Renaissance (vers 1530-1550), plus proche des canons classiques, suivie par l’adoption de formes maniéristes (fin de la Renaissance). Le maniérisme portugais, spécialement dans l’architecture laïque, se caractérise par la simplicité dans l’organisation des façades et le manque relatif de décoration, souvent appelé Estilo Chão (style plain). Même avec l’arrivée de l’architecture baroque à la fin du 17ème siècle, l’architecture portugaise a continué à utiliser des formes maniéristes jusqu’au 18ème siècle.
Architecture religieuse
L’un des exemples les plus importants du style manuélin est le monastère Jerónimos de Lisbonne, dans lequel les ornements de la Renaissance décorent les portails, les colonnes de l’église et les fermetures. L’abandon définitif de l’architecture gothique et les premières structures «pures» de la Renaissance apparaissent plus tard au 16ème siècle, sous le roi Jean III, comme la chapelle de Nossa Senhora da Conceição à Tomar (1532-1540), la Porta Especiosa de la cathédrale de Coimbra et L’église de Graça à Évora (vers 1530-1540), ainsi que le cloître de la cathédrale de Viseu (vers 1528-1534) et le couvent du Christ à Tomar (Cloitres de Jean III, 1557-1591).
Les églises manuélines comme celle du monastère Jerónimos anticipaient l’unification de l’espace intérieur (voir Église Hall) qui caractériserait les églises de la Renaissance comme l’église Mercy de Santarém (après 1559), l’église Santo Antão d’Évora (1557-63) et les cathédrales de Leiria (après 1550) et Portalegre (après 1556).
L’église São Roque (1565-1587) et le monastère de São Vicente de Fora (1582-1629), tous deux situés à Lisbonne, ont fortement influencé l’architecture religieuse du Portugal et de ses colonies outre-mer au cours des siècles suivants. Les églises maniéristes influencées par ceux-ci comprennent les églises jésuites de Coimbra (Nouvelle Cathédrale de Coimbra, commencé en 1598) et Salvador da Bahia, au Brésil (aujourd’hui la cathédrale de Salvador, deuxième moitié du 17ème siècle).
Architecture laïque
Un exemple important et rare de palais urbain de la Renaissance est la Casa dos Bicos (vers 1525) à Lisbonne, avec une façade couverte de reliefs de diamants à la mode italienne. Au cours de la première moitié du XVIe siècle, la noblesse portugaise a construit diverses quintas dans les environs de Lisbonne. Parmi ceux-ci, la Quinta da Bacalhoa (1528-1554), près de Setúbal, est la plus importante, bien que récemment ruinée et dégradée après sa vente à une cave. Contrairement aux palais médiévaux portugais, comme le palais royal de Sintra, les façades du palais Bacalhoa présentent un arrangement symétrique de fenêtres, loggias et tours et le bâtiment est entouré d’un lac artificiel et de jardins géométriques, un ensemble qui révèle l’inspiration italienne. Aussi près de Setúbal se trouve la Quinta das Torres (vers 1560), caractérisée également par ses façades symétriques et un pavillon de tempietto au milieu de son lac artificiel.
Le palais de Ribeira de Lisbonne, un palais royal construit au début du 16ème siècle dans le style manuélin par le roi Manuel Ier, a été remodelé vers la fin du 16ème siècle par les ordres de Philippe Ier (Philippe II d’Espagne). À cette époque, la façade du palais a été modernisée et une grande tour de style Renaissance avec un dôme a été construite par le Tage. Le palais et sa tour dominante ont dominé le paysage urbain de Lisbonne jusqu’en 1755, lorsque le grand tremblement de terre de Lisbonne l’a détruit. Avec la destruction du palais royal, le palais ducal de Vila Viçosa, construit entre la fin du XVIe et le début du XVIIe siècle pour les ducs de Bragance, est peut-être le plus important palais de la Renaissance tardive au Portugal.