هناك العديد من القضايا الاجتماعية والاقتصادية والبيئية والتقنية مع إنتاج واستخدام الوقود الحيوي ، والتي نوقشت في وسائل الإعلام الشعبية والمجلات العلمية. وتشمل هذه العوامل: تأثير انخفاض أسعار النفط ، ومناقشة “الغذاء مقابل الوقود” ، وإمكانية الحد من الفقر ، ومستويات انبعاثات الكربون ، وإنتاج الوقود الحيوي المستدام ، وإزالة الغابات…